口服维生素B、C可增进机体的抵抗力，有助于溃疡愈合。疼痛明显，溃疡较多，间歇期较短的可试用左旋咪唑，转移因子或胸腺素等免疫调节药物治疗，亦可使用糖皮质激素，如强的松治疗。此外，全身其他治疗也很重要，如给与镇静，安眠，调节神经及消化道功能的药物。

用5%金霉素鱼肝油糊剂；1%氢化可的松或强的松糊剂；中成药如冰硼散，锡类散，养阴生肌散等药防止继发感染。但不宜用石炭酸类或硝酸银烧灼溃疡，以免损伤健康的组织。

口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。

以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。

本病容易治愈，但易复发。