肺炎链球菌脑膜炎在婴儿期较多见，新生儿也可发病。肺炎链球菌脑膜炎的发病率仅次于流行性脑脊髓膜炎，常继发于上呼吸道感染、中耳炎、肺炎、鼻窦炎、乳突炎、败血症和颅脑外伤。在儿童脾切除术后、先天性免疫功能缺陷、长期应用免疫抑制剂等情况下，肺炎链球菌脑膜炎可多次发作。